La historia de Gundam Build Fighters Try toma lugar siete años después del final de la primera serie, cuando Iori Sei y Reiji ganaron el 7° Campeonato Mundial de Batallas Gunpla. Ahora el Club de Batallas Gunpla de la Academia Seiho tiene un solo miembro, Hoshino Fumina, una estudiante de tercer año. Como la presidenta del club, ella necesita dos miembros más para participar en los venideros Campeonatos All-Japan de Batallas Gunpla. Un día ella se encuentra con un estudiante transferido llamado Kamiki Sekai, quien ha venido a entrenar Kenpo con su maestro. Luego se une un joven constructor de Gunplas, Kousaka Yuuma, y así su desafío da inicio…