Una noche, El estudiante de secundaria Sho Fukamachi descubre un misterioso objeto metálico. Luego, en un destello cegador de la luz, Sho descubre que tiene accidentalmente fusionado con el Guyver, un mecanismo de diseño extranjero misterioso. Ahora, para salvar a su novia, Mizuki Segawa, junto con todo el mundo, Sho debe convertirse en el Guyver para luchar contra la Corporación Chronos y sus biocreatures, llamado Zoanoids, que están empeñados en dominar el mundo.