9-nine- es una historia sobre la ciudad de Shiromitsugawa, que alberga misteriosos artefactos y los superpoderes que otorgan a sus usuarios. Una historia de creciente confianza e incipiente romance entre el protagonista y la heroína, y también un misterio de asesinato en el que persiguen al culpable de una serie de asesinatos sobrenaturales.