La estudiante de secundaria Hitomi Kanzaki se transporta desde la Tierra al mágico mundo de Gaea, donde conoce al joven príncipe Van Fanel, y está atrapada en la búsqueda por unir a los países de Gaea contra el amenazador Imperio Zaibach. En el camino, ella descubre una habilidad oculta y se esfuerza por desentrañar los de misterios que rodean a Van, su pasado, y la máquina gigante conocida como Escaflowne.